本局實驗室具有精密檢測儀器及完善空間設施，執行多樣化檢驗項目，包括化學測試領域及醫學領域，且獲得財團法人全國認證基金會（Taiwan Accreditation Foundation，TAF）及衛生福利部食品藥物管理署認證，符合國際標準（ISO/IEC 17025以及ISO/IEC 15189），並通過英國FAPAS（Food Analysis Performance Assessment）、衛福部食藥署以及行政院農委會藥毒所檢驗能力試驗，在檢驗品質上具有國際認可水準，肩負北區動物用藥聯合分工專責檢驗重任。
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