申請須以單一單位之單一服務、技術、流程、產品提出申請。
申請項目須符合相關法令，不得有標示不實、侵權、仿冒或其他違反智慧財產權情事。
申請機構提交之計畫書與各式佐證報告須屬實正確。若經查證不實，將取消申請或終止授權，三年內不得再申請，並由申請機構自行承擔法律責任。
認證單位與審查委員對申請資料負有保密義務，但所有申請文件、附件與實體產品，無論結果，均不予退還。
進入各階段審查流程後，申請單位不得以棄權或退件理由要求退還申請費用。
通過認證之項目需於收到正式函文通知後，簽署「SNQ國家品質標章使用授權約定書」始可正式使用「SNQ國家品質標章」相關標示。
表彰在保健食品、健康食品、營養膳食與特殊營養食品、特殊機能保健原料等領域具卓越表現之產品。
適用類組｜藥品類、中藥品類、醫療暨保健器材類、醫療週邊服務與產品類、智慧科技類、高齡健康暨長照類、營養保健類、化粧品暨用品類、防疫產品類、動物用服務與產品類
一律採線上申請，請至「SNQ 官網（www.snq.org.tw）首頁」點擊「申請認證」。
登入「申請暨審查資料維護專區」填寫申請表、下載申請文件格式。
依規定繳交申請費用及上傳申請資料，經主辦單位確認受理後始完成申請。
於線上系統填妥申請表、列印並加蓋單位大小章後，掃描 PDF 檔案上傳。
請依各類組計畫書格式撰寫完成後，以無加密之 PDF 檔案上傳。（文件內容須清楚完整並含相關佐證資料）
① 照片 3–5 張（jpg 或 png，尺寸寬 1000 × 高 750px（4:3 橫長方形）以上、解析度 300dpi 以上）。產品類請提供產品去背照，首圖需縮小置中並完整露出，輪廓不可被上下左右邊緣切到產品的任何部位；其他特寫圖則不受此限。技術或服務項目請提供可呈現主題、流程、特色、團隊之照片；營養保健類另需提供產品包裝與標示近照。② 申請單位 logo（jpg 或 png、解析度 300dpi 以上）。
請檢附內／外包裝完整且與市面上販售樣式和規格相同之產品；若有不同規格，每種規格各十份，親送或以掛號郵寄至「115 台北市南港區忠孝東路七段 508 號 1 樓 SNQ 國家品質標章行政小組 收」。（無實體產品者免附；大型產品請先與承辦人員確認產品檢附事宜。）
藥品、中藥品、醫療暨保健器材、醫療週邊服務與產品、智慧科技、高齡健康暨長照、營養保健、化粧品暨用品、防疫產品、動物用服務與產品類。
未通過審查者（含申請資格不符、各階段未通過者，惟資料補件不在此列），將於審查結果公告 30 日內，扣除行政與審查費用三萬元後，餘額以匯款方式退還。惟營養保健類設有兩梯次報名時程，如於第一梯次未通過，為鼓勵精進品質，可於改善後再提出第二梯次審查之申請。
系列產品併案申請費用為：二品項十二萬元，每增加一品項費用增加二萬元。若未通過審查，則扣除行政及審查費用三萬元後，餘額以匯款方式退還。
申請單位於同一年度（相同梯次）提出之申請項目，如符合下列條件得採併案申請；併案時需整合系列產品繳交一份完整計畫書（內含各產品之原料規格及相關檢驗報告）。
主要成分種類及含量相同、營養素成分種類及含量相同、保健訴求與功效相同，且為同一製造廠、相同製程生產之相同劑型產品，僅在風味、口味、色澤有所不同。
主辦單位分別於每年 8 月（第一梯次）、12 月（第二梯次）以正式書面公文通知審查結果，並同步於 SNQ 官網公佈獲選名單。獲選單位需與主辦單位簽訂「SNQ 國家品質標章使用授權約定書」後，該獲選項目始可正式使用「SNQ 國家品質標章」。
審查公告後，主辦單位將不定期至市場通路抽查獲選項目之品質及標章使用情形；若有違反主管機關法令或品質重大缺失者，將取消其標章授權使用資格，並由申請單位自負一切法律責任。
主辦單位將不定期進行製造工廠實地訪視或書面審查；針對製造工廠位於國外者，另訂實地訪查以外之措施。
為確保認證項目持續維持優良品質，自每年 7 月起辦理年度續審作業。申請單位須於授權效期屆滿前三個月提出申請並繳齊相關資料。
通過續審者，得延續「SNQ 國家品質標章」授權資格並參與相關推廣計畫。標章續授權期間為次年 1 月 1 日至 12 月 31 日。
續審項目得同時申請角逐當年度「國家生技醫療品質獎」，其申請流程依當年度新件申請規定辦理。
未於期限內提出續審申請者，授權期滿後不得繼續使用「SNQ 國家品質標章」，且不得再提出續審申請。
續審「行政作業與審查費用」為新台幣二萬元整。如同時申請角逐當年度「國家生技醫療品質獎」者，申請費用為新台幣三萬元整。(若續審未通過或角逐獎項未果，不另退費。)
成份來源、品質管制、製程稽核、安全衛生檢驗、功效性驗證
設立登記之企業與機構(含製造、輸入或代理)
確保產品符合安全與品質標準，促進研發與製造流程精進，提升消費者信任度，並強化在市場的競爭力。
