衛生福利部於 2018 年制定「國家消除 C 型肝炎政策綱領」，盼於 2025 年全面消除 C 型肝炎。
本院配合國家政策「C 型肝炎全口服新藥健保給付執行計畫」，負責高雄監獄及高雄女子監獄的醫療服務。PWID, 即 people who inject drugs、刺青、衛生用具共用等血液傳染疾病高風險散佈的危險因子，使矯正機關擁有比全國平均更高的 C 型肝炎感染率。
矯正機關 C 型肝炎篩檢與治療計畫目標 ( C 肝國家辦公室 )：
a. Anti - HCV 篩檢率 ≧ 90 %。
b. Anti - HCV 陽性個案 HCV - RNA 檢驗率 ≧ 95 %。
c. HCV - RNA 陽性接受 C 型肝炎全口服抗病毒藥物治療
率 ≧ 90 %
高雄監獄及女子監獄 C 型肝炎病毒基因型佔比為GT1(42.72%)＞GT6(28.29%)＞GT3(14.56%)＞GT2(13.72%)，不同於台灣一般族群。本院自106年 6 月至 111年6月止，治療高雄監獄 C 肝患者 433 人，治療失敗 5 人；女子監獄 C 肝患者 281 人，治療失敗 2 人。合計治療 714人，治療失敗 7 人，治癒率達 99.02 %。
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